The correct reading せんめつ uses On'yomi for both kanji. 殲 (せん) means destroy/annihilate, and 滅 (めつ) means destroy/extinguish. せんえつ misreads 滅. かんめつ and けんめつ are incorrect readings for 殲. It means to completely destroy, wipe out, or exterminate a large group of people, animals, or objects.

正読は両方とも音読みの「せんめつ」です。殲 (せん) も滅 (めつ) も「滅ぼす」を意味します。せんえつは滅の誤読です。かんめつやけんめつは殲の誤読です。敵や害虫などを残らず滅ぼし尽くすこと、完全に絶滅させることを指します。