「薬を 飲んで ください」 means "Please take the medicine." In Japanese, you use the verb 「飲む」 (to drink/swallow) for taking medicine. It is combined here with the polite request pattern 「〜て ください」.
「薬を 飲んで ください」は「薬を飲んでください(服用してください)」と丁寧にお願いする表現です。日本語では薬に対して「飲む」を使うため、て形の「飲んで」に「ください」を繋げます。
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