覆す

その考古学上の新発見は、これまでの歴史の定説を根底から＿＿＿ものだった。

The correct verb is '覆す' (kutsuaesu), which means 'to overturn' or 'to reverse.' It's used when a new fact or discovery completely changes a previously accepted idea or theory. '凌ぐ' (shinogu) means 'to surpass' or 'to endure,' used for comparing superiority or getting through hardship. '遮る' (saegiru) means 'to obstruct' or 'to interrupt.' '歪める' (yugameru) means 'to distort' or 'to twist' facts, which implies a deliberate misrepresentation, whereas the discovery objectively changed the theory.

正解は「覆す（くつがえす）」です。これは、それまで定まっていた物事を根本からひっくり返す、という意味です。新しい発見がこれまでの定説を完全に変えてしまった、という文脈に最も合います。「凌ぐ（しのぐ）」は、他より優れる、困難を乗り越えるという意味。「遮る（さえぎる）」は、光や道をふさぐこと。「歪める（ゆがめる）」は、事実をねじ曲げることで、文脈に合いません。