京都 ___ 行ったことがあります。
Either へ (direction) or に (destination/arrival point) indicates the destination of movement for the verb 行く.
移動動詞「行く」の目的地を示す「へ」（方向）または「に」（到達点）が入ります。経験を表す「〜たことがある」の目的地指定です。
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