A: Who is that boy? B: (　　　) is my brother, Tom.

Aさんの質問「Who is that boy?」は、「あの男の子は誰ですか？」という意味です。質問の「that boy」（あの男の子）について答える文なので、男の人を指す代名詞「He」（彼は）を使います。正解は「He」です。「He is my brother, Tom.」で、「彼は私の兄（弟）のトムです。」となります。She (彼女は) は女の人を指すときに使います。