A: Is that your bike? B: (　　　).

Aさんの「Is that your bike?」は、「あれはあなたの自転車ですか？」とたずねる文です。このように 'Is ...?' で聞かれた質問には、'Yes'か'No'で答えたあと、主語とbe動詞を続けます。「that bike（あの自転車）」は代名詞の 'it' で受けるので、答えは「はい、そうです」という意味の「Yes, it is.」か、「いいえ、ちがいます」という意味の「No, it isn't.」になります。したがって、1番の「Yes, it is」が正解です。